A organização que classifica os softwares de videogames e de computadores no Japão, CERO, não aprovou o nível de violência em The Callisto Protocol, e ao impor condições para que ele fosse lançado, a Striking Distance Studios se recusou a cumprir exigências.
Como não houve acordo, o jogo que será lançado mundialmente no dia 2 de dezembro para PlayStation 4, PlayStation 5, Xbox One, Xbox Series X|S e PC, acabou sendo cancelado no país.
Muitos jogos são censurados no Japão.
CERO é bastante rígido quando se trata de conteúdos violentos e nudez.
Em 2020, entidade fez com que cena envolvendo nudez e beijo entre personagens de The Last of Us Part II, fosse removido, para que só então, chegasse ao mercado japonês. Algo que acontece frequentemente com Resident Evil, e já aconteceu com Cyberpunk, Uncharted, Witcher 3 e GTA V.
Jogadores que fizeram a pré-compra da edição física e digital no Japão poderão pedir reembolso.